Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms