Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms