Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf169E9Q7F2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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