Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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