Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms