Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp42B2RQC2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp42B2RQC2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp42B2RQC2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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