Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprsB0V2N1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms