Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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