Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms