Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RNP2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RNP2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms