Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3550W4VSN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms