Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ilf3Q9Z1X4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms