Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mixl1Q9WUI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mixl1Q9WUI0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms