Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Skp1Q9WTX5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp1Q9WTX5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms