Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PplQ9R269 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PplQ9R269 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PplQ9R269 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PplQ9R269 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PplQ9R269 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PplQ9R269 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PplQ9R269 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PplQ9R269 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PplQ9R269 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PplQ9R269 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PplQ9R269 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms