Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VapbQ9QY76 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms