Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms