Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms