Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ripk4Q9ERK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ripk4Q9ERK0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms