Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samd8Q9DA37 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd8Q9DA37 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms