Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actrt1Q9D9J3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actrt1Q9D9J3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms