Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc1Q9D0B8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ribc1Q9D0B8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms