Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx9Q91VH2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx9Q91VH2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.6 ms