Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp1Q8CG19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp1Q8CG19 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltbp1Q8CG19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ltbp1Q8CG19 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.4 ms