Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Skor1Q8BX46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skor1Q8BX46 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms