Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcal1Q8BJL0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms