Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chn2Q80XD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chn2Q80XD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chn2Q80XD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms