Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC45.84■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
NischQ80TM9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
NischQ80TM9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.74■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC45.74■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
NischQ80TM9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NischQ80TM9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC45.61■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
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