Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspg5Q71M36 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspg5Q71M36 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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