Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2810408A11RikQ6NSU2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2810408A11RikQ6NSU2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2810408A11RikQ6NSU2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms