Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ncor1Q60974 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncor1Q60974 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncor1Q60974 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms