Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik1Q60934 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik1Q60934 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik1Q60934 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik1Q60934 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik1Q60934 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik1Q60934 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.2 ms