Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf4Q60793 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms