Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Fam71bQ5STT6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms