Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps41Q5KU39 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps41Q5KU39 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms