Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B230104I21RikQ3USW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B230104I21RikQ3USW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms