Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf3aQ3ULJ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3aQ3ULJ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3aQ3ULJ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms