Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zswim8Q3UHH1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zswim8Q3UHH1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zswim8Q3UHH1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms