Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm4dQ3U2K5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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