Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TchpQ3TVW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TchpQ3TVW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TchpQ3TVW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TchpQ3TVW5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TchpQ3TVW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TchpQ3TVW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TchpQ3TVW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TchpQ3TVW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms