Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc127Q3TC33 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms