Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SobpQ0P5V2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SobpQ0P5V2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SobpQ0P5V2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms