Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn2bQ0KL01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ubxn2bQ0KL01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn2bQ0KL01 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms