Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ptprn2P80560 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ptprn2P80560 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ptprn2P80560 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprn2P80560 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.2 ms