Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps5P59438 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps5P59438 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps5P59438 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps5P59438 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps5P59438 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps5P59438 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps5P59438 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps5P59438 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps5P59438 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps5P59438 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hps5P59438 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps5P59438 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms