Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctbp2P56546 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms