Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VegfbP49766 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VegfbP49766 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VegfbP49766 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VegfbP49766 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfbP49766 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfbP49766 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfbP49766 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms