Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms