Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd1P40201 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd1P40201 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Chd1P40201 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd1P40201 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Chd1P40201 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Chd1P40201 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Chd1P40201 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chd1P40201 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd1P40201 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms