Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf1P39428 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf1P39428 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf1P39428 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf1P39428 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms