Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddit3P35639 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddit3P35639 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms